El 2 de septiembre de 1915 su madre Giuseppa lo llamó. Él fue a su encuentro y se dio cuenta de que sus manos estaban rojas. Trató de ocultar lo que pasaba y dijo: ′′ Son pequeños dolores ". Ya eran realmente los estigmas (en ese momento, invisibles).
Los dolores han aumentado y se han extendido al pecho, al corazón y a los pies. Le escribía a su director espiritual: ′′ Mi corazón, mis pies y mis manos parecen estar traspasados por una espada ".
En el coro de la Iglesia, junto a otros religiosos, el Padre Pío rezaba la liturgia de las horas. Al terminar, sus hermanos se retiraban, dejándolo recogido en oración. Recibió los estigmas orando frente a un Crucifxo. Tus manos y tus pies sangraban Era 20 de septiembre de 1918. Se notaban, sin embargo, dos hechos importantes: la sangre que salía de sus pies y de sus manos era de un agradable perfume y no coagulación. También de tu pecho salía sangre.
Todo el vecindario supo de lo ocurrido que se extendió rápidamente. Miles de personas querían, ya en aquella época, estar con el santo, llegar a San Giovanni Rotondo, su tierra, para confesarse y participar en la Misa.
Las llagas de sus pies y de sus manos median 2 cm; eran visibles desde ambos lados. La llaga del pecho promedio aproximadamente 7 cm de largo y 5 cm de ancho, pareciendo una cruz volteada.
Médicos y estudiosos decían que sus llagas eran sobrenaturales, ya que no causaban infección, no cicatrización y no aumentaban o disminuían de tamaño.
Durante la noche llevaba guantes blancos de lana que amanecían empapados. Tu pecho siempre estaba envuelto por una pista.
Cierta vez una señora preguntó si sus llagas dolían: ′′ Piensa ", decía San Padre Pío, ′′ que las tengo de adorno?" La mujer continuó: ′′ Responde, entonces, cómo es el dolor que sientes con estas llagas ?" ′′ Es así: toma un clavo, atraviésalo de un lado a otro de tu mano, déjalo y gíralo de allí." Podemos entonces calcular cuánto sufrías. Durante las Santas Misas y la Cuaresma, el dolor venía más intensamente.
Durante cincuenta años, el Padre Pio permaneció con las llagas . Podría decir como São Paulo: No soy yo quien vive, sino que es Cristo quien vive en mí ".
